Nacido el 20 de octubre de 1913 en el pueblo de Bogdanovka, ahora parte del raión Yagotinski de la región de Kiev (Ucrania), Mijaíl Zajárovich Bondarenko provenía de una familia campesina. Completó la escuela FZO y trabajó como herrero en la fábrica «Arsenal» de Kiev.
Se unió al Ejército Rojo en 1936 y se graduó de la Escuela Militar de Aviación de Kachinsk en 1939. Bondarenko participó en la Guerra Soviético-Finlandesa de 1939-1940, realizando 17 misiones de combate a bordo de un I-16.
Héroe de la Unión Soviética
Desde junio de 1941, Bondarenko fue un participante activo en la Gran Guerra Patria. Sirvió como comandante de sección, escuadrón y luego como navegante de regimiento. Para abril de 1942, como comandante de escuadrón del 198º Regimiento de Aviación de Asalto, el teniente Bondarenko había completado 112 salidas de combate.
Sus misiones incluyeron ataques a aeródromos, nudos ferroviarios, y fuerzas y equipos enemigos. Durante estas operaciones, destruyó personalmente cuatro aviones en tierra. Por sus méritos, Mijaíl Zajárovich Bondarenko fue galardonado con el título de Héroe de la Unión Soviética, la Orden de Lenin y la medalla «Estrella de Oro» el 6 de junio de 1942.
Doble Héroe de la Unión Soviética
El 24 de agosto de 1943, el Mayor Bondarenko, entonces navegante del mismo regimiento, fue condecorado con una segunda medalla «Estrella de Oro». Este segundo reconocimiento fue por 106 salidas de combate adicionales, durante las cuales destruyó otros 20 aviones enemigos en tierra.
Realizó su última misión de combate en noviembre de 1943. Posteriormente, desde finales de 1943, estudió en la Academia de la Fuerza Aérea, de donde se graduó en 1946. Después de su graduación, comandó un regimiento de aviación.
Legado y Fallecimiento
Mijaíl Zajárovich Bondarenko falleció el 27 de julio de 1947 y fue sepultado en su pueblo natal de Bogdanovka. Fue condecorado con dos Órdenes de Lenin, dos Órdenes de la Bandera Roja y varias medallas. En su honor, se erigió un busto de bronce en su lugar de nacimiento y una calle en Bogdanovka lleva su nombre.