Eberhard Bock comenzó su carrera en el JG 3 en mayo de 1940. Consiguió su primera victoria el 15 de mayo al derribar un Morane 406 francés. Al final de la campaña francesa, ya sumaba un total de 4 victorias. Durante la Batalla de Inglaterra, derribó otros cuatro aviones enemigos, convirtiéndose en un momento dado en el piloto más exitoso del I./JG 3.
El 1 de septiembre, el Oberleutnant Bock asumió el cargo de Staffelkapitän en el 3./JG 3. El 2 de diciembre de 1940, tras regresar de un ataque a las Islas Británicas, se quedó sin combustible y tuvo que realizar un aterrizaje de emergencia en la costa francesa del Canal.
Carrera Temprana y el Frente Oriental
Al finalizar 1940, Bock había derribado 8 aviones enemigos. Lideró el 3./JG 3 en el momento de la invasión de la URSS. El 24 de junio, durante una salida en la región de Lutsk, su Bf 109 F-2 (W.Nr. 5477) “amarillo 3” fue derribado por la artillería antiaérea; el piloto realizó un aterrizaje de emergencia detrás de la línea del frente, logró evitar ser capturado y regresó al aeródromo al día siguiente.
Obtuvo su 10.ª victoria el 29 de junio, derribando un Pe-2, y su 20.ª el 10 de julio. Sin embargo, ese mismo día, durante otra salida en la región de Kiev, su Bf 109 F-2 (W.Nr. 6818) resultó dañado y el piloto apenas logró aterrizar el avión averiado en el aeródromo de Vasylkiv. A principios de octubre, el I./JG 3 fue retirado a Alemania.
Servicio en Europa Occidental
En Magdeburgo, los pilotos recibieron los nuevos Bf 109 F-4. A partir de diciembre de 1941, los pilotos comenzaron a operar desde bases en Holanda. El 15 de enero de 1942, el 3./JG 3 se transformó en el 6./JG 1. Bock obtuvo dos victorias durante la operación de cobertura para el “Scharnhorst” y el “Gneisenau” el 12 de febrero de 1942.
Tras la muerte de su hermano en el frente, fue retirado a la retaguardia, sirviendo como instructor en el 2./JG 104. Con el inicio de los bombardeos masivos, su unidad fue desplegada para repeler los ataques. En este período, logró derribar tres bombarderos estadounidenses.
Misiones Finales y Muerte
A partir del 2 de mayo de 1944, comenzó a volar con el 5./JG 27. Consiguió sus dos últimas victorias (la 27.ª y la 28.ª) sobre Herausschuss, derribando un B-17.
Eberhard Bock fue derribado y murió el 28 de mayo de 1944, en combate contra un P-51 de la USAAF. El piloto logró saltar en paracaídas de su BF 109 G-6 (W.Nr. 441 324) “negro 6”, pero se golpeó la cabeza contra la cola del avión y falleció.